今年推出闽台高校联合培养人才项目。该项目由学校与台湾云林科技大学、台湾台南科技大学等台湾高校采取“3+1分段对接”方式联合培养本科层次高素质创新型专业人才，计划招生360人。学生在福建工程学院学习三年，在台湾合作大学学习一年，修完学分后由福建工程学院颁发学历学位证书，台湾合作大学出具课程学习成绩证明或结业证书。2010年学校与台湾云林科技大学等台湾高校合作举办的专业有土木工程、机械设计制造及其自动化、通信工程、材料成型及控制工程；与台湾台南科技大学合作举办数字媒体技术（动漫方向）。